Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg16l2Q6KAU8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l2Q6KAU8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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