Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms