Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms