Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sv2cQ69ZS6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sv2cQ69ZS6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms