Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms