Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms