Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms