Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms