Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Aebp1Q640N1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms