Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms