Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms