Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SelplgQ62170 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SelplgQ62170 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms