Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms