Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Phox2aQ62066 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Phox2aQ62066 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phox2aQ62066 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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