Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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