Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms