Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Foxd1Q61345 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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