Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms