Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp7Q60973 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms