Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vdac1Q60932 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vdac1Q60932 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms