Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms