Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms