Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P4ha1Q60715 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha1Q60715 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms