Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CttnQ60598 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms