Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tdrd5Q5VCS6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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