Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms