Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmprss11eQ5S248 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms