Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trdv4Q5R1A3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms