Protein–RNA interactions for Protein: Q5F201

Cfap52, Cilia- and flagella-associated protein 52, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap52Q5F201 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap52Q5F201 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap52Q5F201 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms