Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xirp2Q4U4S6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms