Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxn3Q499D0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Foxn3Q499D0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms