Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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