Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms