Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms