Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms