Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prdm6Q3UZD5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms