Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms