Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms