Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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