Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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