Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BB287469Q3UT53 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BB287469Q3UT53 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms