Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms