Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms