Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms