Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms