Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms