Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kdm4dQ3U2K5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms