Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms