Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms