Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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